才能が因子という形で具現化して全てを決める時代――覇王因子(ヴァンキッシュ・ファクター)に目覚めた少年・桐生将人は、最初の危機を乗り越え、奴隷とした少女たちと平穏な生活を送ろうとした矢先、新たな刺客の襲撃を受ける。クレス・バーフィールド=勇者因子(ブレイブ・ファクター)を持つ『王の因子』所有者を追っている少女である。色々と常識はずれで人の話を聞かないクレスをやむをえず奴隷化した将人は、彼女を通じて学園内に彼以外の王がいることを知る。暴走気味のクレスに呆れながらも、王同士の衝突を避けたい将人。だが、勇者を配下とした覇王を敵の王=魔王が放っておくはずもなく、将人は学園全体を巻き込んだ王同士の抗争へ巻き込まれるのだった――覇道のサバイバル・アクション第2弾!